为了能够再度挑战武斗道馆，而不断修行的小智，终于要向拳击徽章的持有者藤树发出复仇战了；可是在藤树的秘密练习场的战斗，攻守状况却和上次的对战颠倒了过来，面对藤树攻势如潮的宝可梦，小智发挥了修行的成果，在轻松闪躲中慎重地寻找机会；藤树的宝可梦果然因为不断发出攻击，很快就喘不过气来了。任谁来看都会觉得小智占了上风，但是明龖却有不同的看法，在藤树这宛如故意制造机会给小智的战斗中，感到隐隐约约的“无聊”；最后又是意志品质的比拼，藤树的铁掌力士还不错，但绝对不是他的主力，道馆战还是要以引导为主的。腕力在和木守宫的对抗中消耗很大，小智反应过来又替换了龙虾小兵登场，腕力最后体力不支落败，但龙虾小兵也有损伤，也被铁掌力士很快击败；又到了木守宫和铁掌力士的对决，小智指挥木守宫用拍击针对对手的下盘，铁掌力士有点像拳击手，只有站立技腿部毫无配合攻击，即使这样也是拖到了“大招”时刻，比什么坚韧不拔，小智和他的宝可梦是真的天下无敌。
小智打败藤树，并得到了拳击徽章，接下来他们一行人也就准备前往凯那市；那里是明龖的第二故乡，明龖的七年宝可梦训练家的生涯大部分时间都在这边宅着，凯那市虽然没有道馆，但是有华丽大赛凯那大会，小遥和狩猎凤蝶已经跃跃欲试了。
藤树的称号是“格斗浪潮”，是丰缘地区一顶一的格斗属性大佬，他的战术就是直截了当的物理攻击，他也是个经常喜欢深入思考的人，会将战斗中发生的事与日常生活相比较相结合；藤树的道馆内一片漆黑是为了测试挑战者的胆量（他们可都没去里面），藤树自己经常在武斗镇周围的险浪中以及一片漆黑的石之洞窟中修炼；他相信全世界都等他掀起下一波巨浪，在谈话中他时常使用冲浪专用术语，并一直在字面上和言外之意中提到“巨浪”。
明龖也有挑战藤树，就在大家回到武斗镇休息调整的间隙；明龖和藤树的对决是3对3，这次武斗道馆的主人派出了腕力、玛沙那还有铁掌力士，明龖则让对方看到了自己的“巨浪”，蓝色蚊香蛙王卡蜜拉和刺龙王敖甲相继出场。藤树还是没有看清明龖的实力，卡蜜**场很快就干掉了腕力，玛沙那上场之后，明龖也就让敖甲出场，“一穿二”干净利索；藤树在武斗岛虽然和大吾关系不错，但还是闭塞了一些，消息不够灵通（感觉大吾在挖坑），没给明龖什么压力，拳击徽章也就简单拿下。但他们之间还是感觉不错，就是明龖过于冷漠，让热血的藤树也无从下口，有机会他们肯定是还要好好的打上一场，两个人这次其实都还有点遗憾。
两个刺龙王是敖甲和敖乙，很好理解，刺龙王也被认为是龙的私生子，敖丙的戏份那么多，两位哥哥应该就是家庭地位比较一般，这是在宝可梦世界专属于明龖的恶趣味；两只蓝色牛蛙君就又是另外的一个“典故”，蓝色青蛙象征着幸福，被誉为幸福使者。那么幸福是什么，幸福就是猫吃鱼狗吃肉奥特曼打小怪兽，姑且认为她两都是奥特曼，一个叫卡蜜拉还有一个是格丽乔；这两个名字其实还有冥冥之中的深意，希望这个永远不要来临。
小智一行人结束武斗道馆的“复仇”战，为了小遥即将参加的宝可梦华丽大赛（大小姐的特权），而搭船前往大会场地的凯那市。由于火箭队设下的圈套，他们上了火箭队的贼船船遇“难”了；小智依旧沉浸在收获第二个徽章的喜悦之中，今天有点急迫的三人组就又一次开始了“永恒的主题”—抢夺宝可梦，但还是不变的结局，反正打死是不可能的，但每次的感觉都不太好。之后乘坐的船只燃料耗尽，小智等人只能顺水飘流，最后遇上了气氛阴森的触礁搁浅的弃船。
在那里，一行人结识了来调查弃船的广海，一同休息了一段时间，因为广海也是自己开船来到这里，刚好可以一起回到凯那市。广海称自己是来调查这艘搁浅了好多年的船是否有必要被移走的，并且他和他的沼跃鱼当初在这艘船上走失了，因此他想在弃船上找寻自己的沼跃鱼。在广海调查的过程中，小遥的火稚鸡突然不见了，于是广海帮助小智等人一起寻找，但很快小胜和小遥也在发出惊叫后失踪；后来，事件的始作俑者巨沼怪被皮卡丘的招式命中并出现在了三人面前，广海和小智、明龖便跟着巨沼怪来到了小遥等人所在的房间，房间里很热闹还有今天再次出场的火箭队三人组。在巨沼怪击败小智的龙虾小兵后，广海制止了小智派出皮卡丘与巨沼怪继续对战的决定，并告诉小智这只巨沼怪很有可能是由他的沼跃鱼进化而来。
广海试图和巨沼怪交流，但他很快被巨沼怪用泥巴射击攻击，不过他还是没有放弃，不断和巨沼怪讲着它过去进化、学会铁尾的故事，努力向它解释自己当初不是主动抛弃这个伙伴的，并最终感化了巨沼怪。之后，广海为巨沼怪的所作所为对小遥和小胜道歉，并让巨沼怪打飞了想要使坏的火箭队；在回到甲板后，广海告诉小智等人他打算进一步整理弃船，考虑到船内有很多的水系宝可梦，而且还有很多的渡海宝可梦在这边休息，他将和巨沼怪一起来管理这片宝可梦的“绿洲”；当然在最后广海和巨沼怪还是开船送明龖一行人到了港口城市凯那市。
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